Clementia đã hạ sinh một đứa con trai, John the Posthumous (John hậu duệ), vào ngày 13 tháng 11 năm 1316, nhưng chẳng may John đã qua đời năm ngày sau đó[9] vì bệnh dịch. Chú của Joan, Odo IV, Công tước xứ Burgundy, người ở Paris, đã tham gia đàm phán với con trai thứ hai của Philip IV, Philip V, để bảo vệ lợi ích của Joan, nhưng Philip không đáp ứng yêu cầu của Odo[8]. Thay vào đó, ông đã bí mật sắp xếp cho lễ đăng quang của riêng mình, diễn ra tại Reims vào ngày 9 tháng 1 năm 1317[8][9]. Cùng năm 1317, một hội đồng của các lãnh chúa Pháp đã củng cố vị trí của Philip vào ngày 2 tháng 2, tuyên bố rằng một người phụ nữ không thể thừa kế vương miện Pháp[10]. Các quý tộc người Navarre đã phái một phái đoàn đến Paris để thề trung thành với Philip.[11] Philip cũng từ chối đưa Champagne và Brie cho Joan.[12]

Bà ngoại của Joan, Agnes của Pháp, Nữ công tước xứ Burgundy, đã gửi thư cho các lãnh chúa hàng đầu của Pháp, phản đối việc đăng quang của ông, nhưng Philip V đã lên ngôi mà không có sự phản đối nào cả[9][10]. Những lá thư cũng được viết cho các lãnh chúa của Champagne dưới tên của Joan, kêu gọi họ kiềm chế không tỏ lòng tôn kính với Philip và để bảo vệ quyền của Joan đối với Champagne[13]. Trong một bức thư khác, Odo IV lập luận rằng sự khinh miệt của Joan bởi Philip V đã đi ngược lại "quyền thiêng liêng của pháp luật, theo thông lệ, trong cách sử dụng được giữ trong các trường hợp tương tự ở các đế chế, vương quốc, những kẻ đáng sợ, trong các thời kỳ như vậy không có ký ức ngược lại "[13]. Tuy nhiên, chú của Philip V, Charles xứ Valois, đã đánh bại những người ủng hộ Joan.[9]

Philip và Odo đã ký kết một thỏa thuận vào ngày 27 tháng 3 năm 1318[9][13]. Philip đã cho con gái lớn của mình (cũng được đặt tên là Joan) kết hôn với Odo, công nhận họ là người thừa kế của các hạt Burgundy và Artois, trong khi Joan kết hôn với anh họ của bà, Philip của Évreux, với của hồi môn 15.000 livres tournois trong tiền thuê nhà và quyền thừa kế Champagne và Brie nếu Philip V băng hà mà không để lại con trai.[13] Một số người đàn ông cũng đồng ý rằng Joan sẽ từ bỏ yêu sách của mình với Pháp và Navarre khi mới 12 tuổi[14]. Không có bằng chứng cho thấy việc từ bỏ từng diễn ra.[15] Hôn lễ của Joan và Philip được tổ chức vào ngày 18 tháng 6 năm 1318[16]. Sau đó, Joan sống với bà của chồng cô, Marie xứ Brabant.[17] Mặc dù họ sống gần nhau, nhưng Philip và Joan không được nuôi dưỡng cùng nhau do chênh lệch tuổi tác[18]. Cuộc hôn nhân chỉ được hoàn thành từ năm 1324.[19]